Benekli El Balığının Genomu Dizilendi

Benekli el balığı ( Brachionichthys hirsutus ). Resim kredisi: CSIRO.

Benekli El Balığının Genomu Dizilendi

CSIRO'daki bir araştırma ekibi, Tazmanya'ya özgü, nesli kritik derecede tehlike altında olan bir deniz balığı türü olan benekli el balığının ( Brachionichthys hirsutus ) genomunu çözdü .

Brachionichthys hirsutus, Brachionichthyidae el balığı ailesinden nadir bir bentik balık türüdür .

Bu sıra dışı balık yalnızca Tasmanya'daki Derwent Nehri ağzında ve yakın bölgelerde yaşar; genellikle 5 ila 10 m) derinliklerde bulunurlar.

İlk kez 1804 yılında resmi olarak tanımlanan Brachionichthys hirsutus'un , el gibi görünen ve deniz tabanında yürümesini sağlayan son derece adapte olmuş pektoral yüzgeçleri vardır .

Türün beslenme listesinde küçük kabuklu deniz hayvanları, karides ve çok kıllı solucanlar yer almaktadır.

Brachionichthys hirsutus, IUCN Kırmızı Listesi 2020'de Kritik Tehlike Altında olarak sınıflandırılmıştır ; bilim insanları doğada 2.000'den az bireyin kaldığını tahmin etmektedir.

Türlerin hızla azalmasının nedenleri arasında tarihi balıkçılık uygulamaları, kıyı şeridindeki gelişmeler, iklim değişikliği ve istilacı türlerin gelişi yer alıyor.

CSIRO araştırmacısı Gunjan Pandey, “Genom dizisi, popülasyon sayısını artırma ve genetik çeşitliliği izleme yönündeki devam eden çabalara yardımcı olacak” dedi.

"Genom, bir organizmanın nasıl işlediğini anlamamıza yardımcı olur."

“Günlük yaşamda gen ifadesini anlamak için bir temel sağlıyor ve evrimsel geçmişine dair içgörüler sunuyor.”

"Genom sayesinde türlerin tespitine yardımcı olabiliyor, popülasyonları izleyebiliyor ve hatta balıkların yaşam sürelerini tahmin edebiliyoruz."

CSIRO araştırmacısı Carlie Devine ise, "Bu zengin genetik bilgi, uzun vadede koruma stratejisinin belirlenmesine yardımcı olacak" diye ekledi.

"Koruma önlemleri, ekoloji araştırmalarının yanı sıra çok disiplinli bir yaklaşımın tehdit altındaki türlerin etkili bir şekilde korunması için gerekli olduğunu kabul ederek genetiği de kapsayacak şekilde genişliyor."

"Benekli el balığı gibi deniz canlılarıyla çalışmak oldukça zordur."

“DNA hızla bozuluyor ve mikroorganizmalarla kirleniyor.”

"Bu durum saf bir genomun bir araya getirilmesini son derece zorlaştırıyor."

Ekip, düşük girdi protokolü adı verilen bir yöntem kullanarak, az miktarda düşük kaliteli DNA'dan tüm genomu dizilemeyi başardı.

Dr. Pandey, “Bu protokolü dünya çapında kullanan sadece üç ekipten biriyiz” dedi.

“Laboratuvarın kurulumundan biyoenformatik yazılımına kadar tüm süreci, düşük kaliteli DNA'dan yüksek kaliteli bir genom dizilemek için özelleştirdik.”

"Eskiden altı ila on iki ay süren şeyi artık günler içinde başarabiliyoruz. Bu teknoloji, Avustralya ve dünya çapında nesli tükenmekte olan türlerin anlaşılması ve korunması için büyük bir vaat taşıyor.",

#Brachionichthys hirsutus # pektoral yüzgeçler # popülasyon # genetik # genom # ekoloji # mikroorganizma