Bilgisayar Programı İnsan Hücreleri Arasındaki Farklılıkları Algılar
“ İnsan vücudunda hücre tiplerinde ne kadar farklılık vardır? Ve bu farklılıklar nasıl gelişir? Kimse bilmiyor.” Der Profesör Stein Aerts. Credit: KU Leuven
Ama takımının geliştirdiği yeni bir metot sayesinde bu, değişebilir. Vücudumuzdaki hücrelerin her biri aynı DNA dizisi taşır. Hücre tiplerinin ve fonksiyonlarının büyük bir çeşitliliği vardır. Bu farklılıklar, DNA dizilişinin nasıl yorumlanacağını gösterir:
” Her hücrede bütün genler açık değildir.”
İnsan vücudundaki hücreler 30 trilyondan fazladır. Bu teknikler, biyolojide ve tıpta devrim araştırmaların detayının görülmemiş bir düzeyini sağlar. Biyolog Stein Aerts ve onun takımı , matematikçiler ve biyomühendislerle bu soruna katıldı. ”Biz , insanların genlerinin ifade şekillerini üzerinde hücre tiplerinin benzerlik ve farklılıklarını hızlıca ve hatasız gösteren bir bilgisayar programı geliştirdik. ( SCENIC). Bu teknoloji , hücre tiplerinin kaderinin düzeninin nasıl olduğunu daha iyi anlamamıza izin verir.
” Bu yenilikçi metot , sadece vücudumuzda farklı hücreler hakkında daha fazla bilgi öğrenmemize yardım etmez.” Der Sara Aibar Santos.
” Bu yenilikçi metot , aynı zamanda hücre aktivitelerinin zamanla nasıl değiştiğini söyler.”
Bu takım zaten insan ve farenin neyin dokularında bu metodu uygulamıştı. Aynı zamanda , vücut tümörlerini ve beyindeki kanser hücrelerini karşılaştırdılar ve analiz için kullandılar. Bu metot, İnsan Kanser Atlasını geliştirmede yardımcı olabildi.
” Bu atlas, tıp ve araştırma için bilginin paha biçilemez kaynağıdır. Bu , biyolojik değişikliklerle ilgili farklı hastalıklar ilgili sistematik çalışmalarımız için, farklı hücre tiplerinin analizi ve moleküler mekanizmasını analiz etmek için izin verir.”
Explore further: Cancer-preventing protein finds its own way in our DNA
More information: Sara Aibar et al, SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering, Nature Methods (2017). DOI: 10.1038/nmeth.4463
Journal reference: Nature Methods search and more info website
Provided by: KU Leuven
Kaynak:
https://phys.org/news/2017-10-differences-human-cells.html#jCp
Çeviren ve Derleyen: Merve Erman
Genetik Haberleri
-
Hepimiz Neandertal ve Denisovalı DNA’sı Taşıyoruz
-
Transkripsiyon Nedir? DNA'dan mRNA Nasıl Üretilir?
-
Genom düzenlemesi nedir? Bitkilerde yeni nesil genom düzenlemeleri nasıl yapılır?
-
Yeni Keşfedilen Gen Fotosentetik Verimliliği ve Bitki Üretkenliğini Artırıyor
-
Chimerism ve Poliembrioni Nedir?
-
HEXA Geni Nedir? Görevleri Nelerdir?
-
Yeni nesil genom düzenlemeleri hakkında bilgi
-
Türler arası genom benzerliği ve genom yapısı
-
48 Kromozomlu Atalardan 46 Kromozomlu İnsana Evrimleşme Doğrumudur
-
Genetik Miras Nedir? Zorlu Çevresel Koşulların Yıldıramadığı Genetik Miras Nasıl Aktarılır?
-
Yeni Kaledonya Eğrelti Otu Türü Yaşayan Herhangi Bir Organizmanın En Büyük Genomuna Sahiptir
-
Araştırmacılar Büyük ve Küçük Bilbies'in Genomlarını Sıraladı
-
Güney Amerika Akciğer Balığı Şimdiye Kadar Dizilenen En Büyük Hayvan Genomuna Sahip
-
Benekli El Balığının Genomu Dizilendi
-
Bilim İnsanları Bezelyenin Kromozom Ölçekli Referans Genomunu Yayımladı