HCV Genotipleme
HCV genomu 9600 nükleotid uzunluğundaki tek bir RNA iplikçiğinden oluşur. Genomik dizilerinde çeşitlilik gösteren 6 HCV genotipi bulunur. Avrupa ve Kuzey Amerika’yı da içeren birçok coğrafik bölgede Genotip 1 baskındır. Genotip 2 ve 3’ünde geniş bir yayılımı vardır. Genotip 2 oransal olarak Avrupa, Kuzey Amerika ve Japonya’da yaygındır. Genotip 3 Güneydoğu Asya, Avusturalya, Güney Amerika, Kuzey Avrupa’da özellikle damar içi uyuşturucu kullanıcılarında yaygındır. Genotip 4 özellikle Mısır, Orta Doğu ve Orta Afrika’da, Genotip 5 Güney Afrika’da , Genotip 6 Güneydoğu Asya’da yaygındır.
Genomik dizilerinde çeşitlilik gösteren HCV genotiplerinin bilinmesi tedavinin planlanması açısından büyük önem taşır.
Hepatit C virus (HCV), Flaviviredae ailesinden, bir RNA virüsüdür. Akut hepatitlerin %20’sinden, kronik hepatitlerin ise %70’inden HCV sorumlu tutulmaktadır. Yerleştikleri konakta akut infeksiyon, kronik infeksiyon, siroz ve hepatosellüler karsinom gibi ölümcül hastalıklara neden olurlar. HCV infeksiyonu tüm dünyada yaygın olarak görülebilmekte ve yaklaşık 300 milyon kişinin HCV ile infekte olduğu bildirilmektedir Ülkemizde sağlıklı kişiler ya da kan donörlerinden yapılan seroprevalans çalışmalarında, anti-HCV pozitifliğinin % 0.3-1.8 arasında değiştiği saptanmıştır.
HCV infeksiyonunun tanısında, antikor testleriyle alınan bir sonucun, geçmiş bir infeksiyon mu yoksa devam eden bir infeksiyona mı ait olduğunu belirlemek olanaklı değildir. Bu nedenle, replikasyonun göstergesi olan HCV RNA’nın PCR ile gösterilmesi zorunlu olmuştur.
HCV Genotipleme:
HCV ile ilgili genotip çalışmaları dünyada olduğu gibi ülkemizde de son yıllarda artmıştır. HCV’ de en az 6 genotip, 40’dan fazla subtip bulunmaktadır. Bu genotipler dünyada farklı bölgelerde farklı dağılım göstermektedir. Ülkemizde kronik hepatit, hemodiyaliz hastaları ve kan donörleri ile yapılan çalışmaların sonuçları birbirine paralel olup genotip 1 (özellikle subtip, genotip 1b) en büyük kısmı oluşturmaktadır.
HCV infeksiyonunda farklı genotiplerin, oluşacak hastalık tablosunu farklı biçimlerde etkilediği, tedaviye yanıtta genotipler arasında fark olduğu son yıllarda yapılan çalışmalarda tespit edilmiştir. Bu da HCV’ in genotiplendirmesinin ne kadar gerekli olduğunu göstermektedir.
Materyal : Plazma
Materyal miktarı: 1-2 cc
Kabul günü : Her gün
Analiz süresi : 10 gün
Genomik dizilerinde çeşitlilik gösteren HCV genotiplerinin bilinmesi tedavinin planlanması açısından büyük önem taşır.
Hepatit C virus (HCV), Flaviviredae ailesinden, bir RNA virüsüdür. Akut hepatitlerin %20’sinden, kronik hepatitlerin ise %70’inden HCV sorumlu tutulmaktadır. Yerleştikleri konakta akut infeksiyon, kronik infeksiyon, siroz ve hepatosellüler karsinom gibi ölümcül hastalıklara neden olurlar. HCV infeksiyonu tüm dünyada yaygın olarak görülebilmekte ve yaklaşık 300 milyon kişinin HCV ile infekte olduğu bildirilmektedir Ülkemizde sağlıklı kişiler ya da kan donörlerinden yapılan seroprevalans çalışmalarında, anti-HCV pozitifliğinin % 0.3-1.8 arasında değiştiği saptanmıştır.
HCV infeksiyonunun tanısında, antikor testleriyle alınan bir sonucun, geçmiş bir infeksiyon mu yoksa devam eden bir infeksiyona mı ait olduğunu belirlemek olanaklı değildir. Bu nedenle, replikasyonun göstergesi olan HCV RNA’nın PCR ile gösterilmesi zorunlu olmuştur.
HCV Genotipleme:
HCV ile ilgili genotip çalışmaları dünyada olduğu gibi ülkemizde de son yıllarda artmıştır. HCV’ de en az 6 genotip, 40’dan fazla subtip bulunmaktadır. Bu genotipler dünyada farklı bölgelerde farklı dağılım göstermektedir. Ülkemizde kronik hepatit, hemodiyaliz hastaları ve kan donörleri ile yapılan çalışmaların sonuçları birbirine paralel olup genotip 1 (özellikle subtip, genotip 1b) en büyük kısmı oluşturmaktadır.
HCV infeksiyonunda farklı genotiplerin, oluşacak hastalık tablosunu farklı biçimlerde etkilediği, tedaviye yanıtta genotipler arasında fark olduğu son yıllarda yapılan çalışmalarda tespit edilmiştir. Bu da HCV’ in genotiplendirmesinin ne kadar gerekli olduğunu göstermektedir.
Materyal : Plazma
Materyal miktarı: 1-2 cc
Kabul günü : Her gün
Analiz süresi : 10 gün
Genetik
-
İnsanlarda Kaç Kromozom Vardır?
-
Sık görülen mikrodelesyon sendromları nelerdir?
-
Bilim insanları kromozomları nasıl inceler?
-
Arkea'da Kromozomlar ve DNA Replikasyonu
-
DNA Onarım Mekanizmaları Nelerdir?
-
DNA hasarına neden olan etkenler nelerdir?
-
XYY Süper Erkek Sendromu - JACOB’S, Sendromu
-
Bitki doku kültürü çalışmaları ile haploid bitkiler elde edilebilir
-
Gram pozitif bakterilerden genomik DNA izolasyon protokolü
-
E. coli bakterisinden genomik DNA izolasyon protokolü
-
DNA’nın Keşfi
-
İnsan Genom Projesi Nedir ? Amaçları Nelerdir ?
-
Genomik mikrodizilimlerle ikilenme teşhisi yöntemi
-
Gen duplikasyonu ve amplifikasyonu nedir?
-
DNA ile RNA Arasndaki Farklar ve Benzerlikler Nelerdir