Protein Sekans Analiz Cihazı
The Procise Protein Sekanslama Sistemi protein/peptidlerin N-terminal amino asitlerini sırasıyla keserek, oluşan fenilthiohyantoin (PTH) bağlı amino acid kökünü analiz eder.
Procise sisteminde kullanılan kimyasal proses, 1950 yılında P. Edman tarafından geliştirilen protein ve peptitlerin aşamalı olarak bozunmasına dayalı teknikden türetilmiştir. Edman Degradasyon Tekniğinde, bir proteinin amino ucu spesifik olarak phenylisothiocyanate (PITC) ile reaksiyona girer.
Procise Protein Sekanslama Sistemi Edman Degredasyonu Tekniğini ve PTH- amino asit analizini tamamıyla otomatik hale getirmiştir. Sistem HPLC ayırma, veri sayısallaştırılması, ve protein sekanslama raporu işlemlerinin tümünde tam otomasyon sağlar.
Örnek, sekanslama işlemi süresince sıcaklık kontrollü bir cam reaksiyon kabı içerisinde kalır. Her bozunma reaksiyonu sonunda, uçta bulunan amino asit anilinothiazolinone (ATZ) türevi olarak ayrılır. Daha sonra bu anilinothiazolinone (ATZ) türevi, daha kararlı bir forma, phenylthiohydantoin-amino acid (PTH-AA), dönüştürülmek üzere reaksiyon kabından, ısıtılmış ayrı bir dönüşüm erlenine aktarılır. Sonrasında PTH-AA dönüşüm erleninden sonra gelen ayırma ve Procise HPLC sisteminde sayısallaştırma işlemleri için dönüşüm erleninden enjeksiyon vanasına aktarılır.
PTH bağlı amino asitlerin ayrılması için sıcaklık kontrollü bir ısıtma bloğu içerisindeki bir ters-faz analitik kolon kullanılır. Farklı PTH-amino asitlerin kolona olan ilgilerinin farklı olması nedeniyle, kolondan farklı zamanlarda ayrılırlar.
Tam otomasyon sistemi 7 gün 24 saat çalışma sağlar.
Örnek Özellikleri
Örnekler yalnızca bir protein veya peptid içermelidir.
Örnekler Edman degredasyonunu ve sekanslama işlemini etkileyen maddeler içermemelidir (tampon, SDS, tuzlar, amino asitler, birincil aminler ve diğer bulaşıcı maddeler gibi)
Örnekler jelden polyvinylidene difluoride (PVDF) membrana transfer edilerek Coomassie blue, Ponseau S, or Amido black ile boyanmış şekilde veya solüsyon içerisinde bulunmalıdır.
PDVF membran üzerindeki örnekler, kontaminasyonu en aza indirmek için iyi ayrılmış bantlar halinde bulunmalıdır.
Başarılı bir sekanslama için gerekli protein/peptit miktarı, her sekanslama reaksiyonu başına 20-50 pmol'dur.
Uygulamaları
Dahili sekanslama
Yeni proteinlerin tespiti
Moleküler klonlama için prob tasarımı
Klonların genetik kararlılığının kontrolü
Rekombinant protein ürünlerin uygun işlenmesinin kontrolü
Biyokimya
-
Serum Enzimlerini Tayin Yöntemleri
-
Fosfatazlar (Alkali fosfataz= ALP)
-
Transferazlar
-
Transaminazlar
-
Enzimlerin Görev, İşlev ve Özellikleri - Enzimlerin İsimlendirilmesi
-
Kanda Bilirubin
-
Serum Proteinleri
-
Fosfolipidler
-
Trigliseridler
-
Kolesterol Nedir?
-
Kan Lipitleri Nelerdir?
-
Kan Şekeri Nedir?
-
Araşidonik Asit (ARA) Nedir?
-
Lizozim enzimleri
-
Lizozim: İlk Antibiyotik